變性聚丙烯酰胺凝膠電泳與非變性的區別
我們知道變性聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）是根據寡核苷酸的大小來分離，因此可將全長產物與不完整的短分子分開。電泳時通常每一泳道至少加1mg合成的寡核苷酸，電泳后在紫外燈下定位寡核苷酸條帶，將長度正確的寡核苷酸從凝膠上切下。原理：蛋白質或多肽與SDS結合，經熱變性和二硫鍵的還原，形成所帶負電荷相對一致的非折疊衍生物，其泳動速度主要由分子量決定。
而非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(Native-PAGE)或稱為活性電泳是在不加入SDS 和疏基乙醇等變性劑的條件下，對保持活性的蛋白質進行聚丙烯酰胺凝膠電泳，常用于酶的鑒定、同工酶分析和提純。未加SDS的天然聚丙烯酰胺凝膠電泳可以使生物大分子在電泳過程中保持其天然的形狀和電荷，它們的分離是依據其電泳遷移率的不同和凝膠的分子篩作用，因而可以得到較高的分辨率，尤其是在電泳分離后仍能保持蛋白質和酶等生物大分子的生物活性，對于生物大分子的鑒定有重要意義，其方法是在凝膠上進行兩份相同樣品的電泳，電泳后將凝膠切成兩半，一半用于活性染色，對某個特定的生物大分子進行鑒定，另一半用于所有樣品的染色，以分析樣品中各種生物大分子的種類和含量。
變性聚丙烯酰胺凝膠電泳與非變性聚丙烯酰胺凝膠的區別是非變性凝膠里面沒加變性劑，一般是SDS。非變性膠跑出來的蛋白能保持其活性一般用做功能試驗，如EMSA。由于沒有變性劑的原因非變性膠電泳時除了與蛋白分子量有關也會受都電荷的影響，因此對蛋白等電點的確定和緩沖液的酸堿性有注意，有時需要倒轉電泳時的正負極。從跑的膠來看，變性膠會比較好看，帶比較窄，非變性膠跑出來則比較粗糙。
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